Métodos en Biología de la Conservación

Titulación: Máster en Áreas Protegidas, Recursos Naturales y Biodiversidad
Tipo: Asignatura optativa de 3 créditos (primer cuatrimestre)
Coordinador: José Francisco Calvo Sendín (jfcalvo@um.es)

En esta asignatura imparto los siguientes temas y prácticas:

Tema 1

Principios generales del muestreo de poblaciones

Ecología, poblaciones y Biología de la Conservación. Modelos de población integrados. Introducción al método científico. Fundamentos de probabilidad y estadística. Experimentos y muestreos.
[Presentación]

Lecturas recomendadas:
[Introducción a los métodos de investigación en ecología]
[Experimentos y muestreos]

Libros recomendados para la asignatura:
[Quantitative Conservation of Vertebrates]
[Applied Hierarchical Modeling in Ecology]
[Quantitative Conservation Biology]

Práctica 1

Introducción al diseño e interpretación de modelos ecológicos

Conceptos básicos. Análisis e interpretación de resultados. Procedimientos de selección de modelos.
[Guion] [Recursos]
[Más en: Open Courseware UMU «Ecología metodológica y cuantitativa»]

Tema 2

Modelos de ocupación

Introducción a los modelos jerárquicos. Muestreos y datos de presencia-ausencia. Tipos de modelos de ocupación. Introducción al uso del programa PRESENCE. Diseño e interpretación de los modelos. Selección de modelos y model averaging. Ejemplos multi-season y multi-state. Modelos de ocupación en R: unmarked.
[Presentación]

Práctica 2

Análisis de datos de ocupación

Utilización de PRESENCE y librerías de R para estimación de la ocupación.
[Guion] [Recursos]

Tema 3

Modelos de estimación de la abundancia

Transectos y estaciones de censo. Fundamentos de los muestreos de distancia. Modelos de distancia en R: Distance y unmarked. Estimas de abundancia a partir de conteos. Estimas de abundancia a partir de conteos en R: unmarked.
[Presentación]

Práctica 3

Análisis de datos de abundancia

Utilización de DISTANCE y librerías de R para el análisis de datos de conteos, muestreos de distancia y estimación de la abundancia.
[Guion] [Recursos]

Tema 4

Métodos de captura-marcaje-recaptura

Fundamentos. Estimas de supervivencia: modelo CJS. Estimas de abundancia: modelo POPAN. Asunciones y pruebas de bondad de ajuste. Modelos CJS y POPAN en R: RMark. Modelo known-fate. Modelos multi-state (multistrata).
[Presentación]

Práctica 4

Análisis de datos de individuos marcados

Utilización de MARK y librerías de R para el análisis de individuos marcados y la estimación de abundancia, supervivencia y otros parámetros demográficos.
[Guion] [Recursos]

Tema 5

Modelos de viabilidad de poblaciones

Introducción al análisis de viabilidad de poblaciones. Modelos deterministas y estocásticos. Variabilidad temporal en las tasas vitales. Medidas de viabilidad. Análisis de viabilidad de poblaciones basados en censos. Análisis de viabilidad de poblaciones demográficos. Análisis de sensibilidad. Análisis de viabilidad de poblaciones multisitio. Modelos de población integrados.
[Presentación]

Práctica 5

Análisis de viabilidad de poblaciones

Estimación del riesgo de extinción de poblaciones en R. Análisis de sensibilidad en R.
[Guion] [Recursos]